Nel giugno del 2017 Mancini approda nel campionato russo. Dopo l'esperienza nella Süper Lig (la prima divisione del campionato turco) e quella in Premier League, Mancini inizia una nuova affascinante sfida alla guida dello Zenit.
Totalizza 44 panchine con 21 vittore, 13 pareggi e 10 sconfitte. Lo Zenit chiude con la difesa meno battuta del campionato e si posiziona 5° in classifica.